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Chapitre 0

Cette citation exprime très clairement la démarche d'expertise d'un domaine, que ce soient les mathématiques, la biologie, ou un autre domaine.

Le sujet de cette thèse est : "Amélioration de la robustesse des systèmes d'aide à la description, à la classification et à la détermination des objets biologiques". En tant que biologiste et informaticien de formation, et étant arrivé au terme de cette thèse, je suis très sensible à ces écrits d'un mathématicien du XVIII^èmesiècle certainement influencé par les recherches fructueuses des systématiciens de l'époque. Ces idées ont été reprises par G. Pólya dans son livre "Les mathématiques et le raisonnement plausible" (1957) dont je joins en annexe le premier chapitre sur l'induction et l'analogie en mathématiques. En découvrant ces écrits, je suis heureux de constater que les naturalistes et certains mathématiciens adoptent finalement la même approche pour tirer le meilleur parti possible de leurs expériences : leur démarche commune semble basée sur l'observation intime des faits et un raisonnement "plausible" de type inductif et analogique.

L'expert (mathématicien ou biologiste) qui explore son domaine bâtit des hypothèses (ou conjectures) à partir d'interprétations de ses observations qui indiquent les relations familièresqu'il voit entre les différents objets. Aux nombres des mathématiciens correspondent les spécimens dans une collection pour le biologiste systématicien.

En écrivant ces relations, il aboutit à des formes de description plus ou moins bien établies qui lui permettent de comprendre son domaine. Il peut utiliser pour cela des manières différentes de représenter ses observations : descriptions monographiques, dessins, photos, ces dernières étant certainement les plus délicates pour véhiculer son expertise. Sans relâche, il confronte ses descriptions à la réalité des nouveaux individus pour mieux les connaître. En développant sa familiarité avec les spécimens, c'est un peu comme si l'expert utilisait les mots de sa propre langue et était capable de «lire les spécimens» (comme le mathématicien «lit les nombres») dans une meilleure compréhension de leur structure [Aubé, 1991], ainsi que dans la résolution de problèmes tels que la classification et la détermination en biologie.

Aujourd'hui, avec l'omniprésence des ordinateurs dans les laboratoires de recherche, il devient opportun que l'informaticien coopère avec l'expert dans sa démarche de familiarisation avec les objets de son travail journalier, en lui procurant des outils d'aide :

1) à la modélisation de son savoir (pour structurer ses connaissances), 2) à la mise au point de descriptions d'objets comparables entre elles,
(permettant de systématiser un processus de description suivant une
même structure descriptive),